Η Βικελαία Δημοτική Βιβλιοθήκη συνεργάζεται με πλήθος φορέων και ιδρυμάτων:
- Πανεπιστήμιο Κρήτης
- ΙΤΕ
- Ιστορικό Μουσείο
- Ινστιτούτο Βυζαντινών Σπουδών Βενετίας
- Ιστορική Εθνολογική Εταιρεία
- Πανεπιστημιακές Εκδόσεις Κρήτης
- Εταιρεία Κρητικών Ιστορικών Μελετών
- Μορφωτικό Ίδρυμα Εθνικής Τραπέζης
- Πανεπιστήμιο Ιωαννίνων
- Πανεπιστήμιο Αιγαίου
- Μουσείο Μπενάκη